MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 2833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017136	GCG	2	6	168010	168015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044051
2502	NC_017136	TCG	2	6	168135	168140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044051
2503	NC_017136	GAA	2	6	168160	168165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044051
2504	NC_017136	TCA	2	6	168177	168182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044051
2505	NC_017136	CTT	2	6	168217	168222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044051
2506	NC_017136	C	6	6	168251	168256	0 %	0 %	0 %	100 %	384044051
2507	NC_017136	TGGT	2	8	168276	168283	0 %	50 %	50 %	0 %	384044051
2508	NC_017136	GCCA	2	8	168348	168355	25 %	0 %	25 %	50 %	384044051
2509	NC_017136	AC	3	6	168408	168413	50 %	0 %	0 %	50 %	384044051
2510	NC_017136	CGA	2	6	168448	168453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044051
2511	NC_017136	TG	3	6	168623	168628	0 %	50 %	50 %	0 %	384044051
2512	NC_017136	CCGC	2	8	168639	168646	0 %	0 %	25 %	75 %	384044051
2513	NC_017136	CAC	2	6	168647	168652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044051
2514	NC_017136	TG	3	6	168695	168700	0 %	50 %	50 %	0 %	384044051
2515	NC_017136	CCG	2	6	168954	168959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044051
2516	NC_017136	GAT	2	6	168965	168970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044051
2517	NC_017136	T	6	6	168982	168987	0 %	100 %	0 %	0 %	384044051
2518	NC_017136	TGC	2	6	169338	169343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2519	NC_017136	TGC	2	6	169346	169351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2520	NC_017136	CGG	2	6	169404	169409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044052
2521	NC_017136	CAC	2	6	169506	169511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044052
2522	NC_017136	GGT	2	6	169545	169550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044052
2523	NC_017136	CAC	3	9	169559	169567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044052
2524	NC_017136	GGAT	2	8	169622	169629	25 %	25 %	50 %	0 %	384044052
2525	NC_017136	CAG	2	6	169763	169768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2526	NC_017136	CGA	2	6	169812	169817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2527	NC_017136	GCT	2	6	169858	169863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2528	NC_017136	GGCA	2	8	169898	169905	25 %	0 %	50 %	25 %	384044052
2529	NC_017136	GAT	2	6	169906	169911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044052
2530	NC_017136	GCC	3	9	170055	170063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044052
2531	NC_017136	CG	3	6	170082	170087	0 %	0 %	50 %	50 %	384044052
2532	NC_017136	TGG	2	6	170118	170123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044052
2533	NC_017136	GCA	2	6	170203	170208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2534	NC_017136	ACG	2	6	170252	170257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2535	NC_017136	CCA	2	6	170260	170265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044052
2536	NC_017136	GAA	2	6	170327	170332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044052
2537	NC_017136	CGT	2	6	170368	170373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044052
2538	NC_017136	CA	3	6	170383	170388	50 %	0 %	0 %	50 %	384044052
2539	NC_017136	CAC	2	6	170414	170419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044052
2540	NC_017136	GCC	2	6	170420	170425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044052
2541	NC_017136	TGAG	2	8	170484	170491	25 %	25 %	50 %	0 %	384044053
2542	NC_017136	TTTC	2	8	170514	170521	0 %	75 %	0 %	25 %	384044053
2543	NC_017136	CAG	2	6	170641	170646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044053
2544	NC_017136	CAGC	2	8	170671	170678	25 %	0 %	25 %	50 %	384044053
2545	NC_017136	CAG	2	6	170770	170775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044053
2546	NC_017136	GCA	2	6	170798	170803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044053
2547	NC_017136	GT	3	6	171047	171052	0 %	50 %	50 %	0 %	384044053
2548	NC_017136	CCA	2	6	171053	171058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044053
2549	NC_017136	GCC	2	6	171116	171121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044053
2550	NC_017136	CCA	2	6	171147	171152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044053
2551	NC_017136	GCC	2	6	171166	171171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044053
2552	NC_017136	CGC	2	6	171204	171209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044053
2553	NC_017136	CAG	2	6	171268	171273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044053
2554	NC_017136	GCCATC	2	12	171280	171291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384044053
2555	NC_017136	AG	3	6	171383	171388	50 %	0 %	50 %	0 %	384044053
2556	NC_017136	GTG	2	6	171416	171421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044053
2557	NC_017136	CAT	2	6	171433	171438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044053
2558	NC_017136	GCA	2	6	171467	171472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044054
2559	NC_017136	GAA	2	6	171585	171590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044054
2560	NC_017136	CA	3	6	171733	171738	50 %	0 %	0 %	50 %	384044054
2561	NC_017136	TCCGG	2	10	171776	171785	0 %	20 %	40 %	40 %	384044054
2562	NC_017136	GCA	2	6	171798	171803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044054
2563	NC_017136	GGC	2	6	171804	171809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044054
2564	NC_017136	ATG	2	6	171811	171816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044054
2565	NC_017136	TCA	2	6	171829	171834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044054
2566	NC_017136	TCGCG	2	10	171836	171845	0 %	20 %	40 %	40 %	384044054
2567	NC_017136	CGG	2	6	171889	171894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044054
2568	NC_017136	ACA	2	6	171940	171945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044054
2569	NC_017136	CCCGG	2	10	172043	172052	0 %	0 %	40 %	60 %	384044055
2570	NC_017136	CAC	2	6	172178	172183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044055
2571	NC_017136	TCT	2	6	172360	172365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044055
2572	NC_017136	CTGC	2	8	172372	172379	0 %	25 %	25 %	50 %	384044055
2573	NC_017136	GGC	2	6	172382	172387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044055
2574	NC_017136	GGC	2	6	172455	172460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044055
2575	NC_017136	CCG	2	6	172489	172494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044055
2576	NC_017136	GCA	2	6	172527	172532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044055
2577	NC_017136	GTC	2	6	172560	172565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044055
2578	NC_017136	CAG	2	6	172597	172602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044055
2579	NC_017136	GTCCG	2	10	172647	172656	0 %	20 %	40 %	40 %	384044055
2580	NC_017136	GCCC	2	8	172848	172855	0 %	0 %	25 %	75 %	384044055
2581	NC_017136	AGC	2	6	172863	172868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044055
2582	NC_017136	TGC	2	6	172914	172919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044055
2583	NC_017136	GC	3	6	172918	172923	0 %	0 %	50 %	50 %	384044055
2584	NC_017136	GCC	2	6	173012	173017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044055
2585	NC_017136	GCC	2	6	173172	173177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044056
2586	NC_017136	CAT	2	6	173230	173235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044056
2587	NC_017136	GA	3	6	173328	173333	50 %	0 %	50 %	0 %	384044056
2588	NC_017136	AGC	2	6	173346	173351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044056
2589	NC_017136	CTC	2	6	173352	173357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044056
2590	NC_017136	TGATC	2	10	173397	173406	20 %	40 %	20 %	20 %	384044056
2591	NC_017136	TGA	2	6	173459	173464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044056
2592	NC_017136	CCA	2	6	173502	173507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044056
2593	NC_017136	TTC	2	6	173536	173541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044056
2594	NC_017136	TCA	2	6	173550	173555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044056
2595	NC_017136	GC	3	6	173563	173568	0 %	0 %	50 %	50 %	384044056
2596	NC_017136	CCA	2	6	173625	173630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044056
2597	NC_017136	ACG	2	6	173783	173788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044056
2598	NC_017136	CCA	2	6	173817	173822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044056
2599	NC_017136	ATG	2	6	173843	173848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044056
2600	NC_017136	CGC	2	6	173877	173882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044056
2601	NC_017136	GCTG	2	8	173894	173901	0 %	25 %	50 %	25 %	384044056
2602	NC_017136	CGG	2	6	173970	173975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044056
2603	NC_017136	GCA	2	6	174050	174055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044056
2604	NC_017136	AG	3	6	174102	174107	50 %	0 %	50 %	0 %	384044057
2605	NC_017136	ACG	2	6	174136	174141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044057
2606	NC_017136	AGG	2	6	174146	174151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044057
2607	NC_017136	GGCA	2	8	174243	174250	25 %	0 %	50 %	25 %	384044057
2608	NC_017136	GCC	2	6	174259	174264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044057
2609	NC_017136	AAT	2	6	174271	174276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044057
2610	NC_017136	TTG	2	6	174290	174295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044057
2611	NC_017136	TCA	2	6	174320	174325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044057
2612	NC_017136	CAG	2	6	174376	174381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044057
2613	NC_017136	TAA	2	6	174474	174479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044057
2614	NC_017136	GAA	2	6	174961	174966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044058
2615	NC_017136	ACACC	2	10	174970	174979	40 %	0 %	0 %	60 %	384044058
2616	NC_017136	TTC	2	6	174989	174994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044058
2617	NC_017136	TGC	2	6	175001	175006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044058
2618	NC_017136	GC	5	10	175031	175040	0 %	0 %	50 %	50 %	384044058
2619	NC_017136	TGG	2	6	175043	175048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044058
2620	NC_017136	CAC	2	6	175051	175056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044058
2621	NC_017136	CCA	2	6	175130	175135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044058
2622	NC_017136	GAA	2	6	175246	175251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044058
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2624	NC_017136	CATC	2	8	175474	175481	25 %	25 %	0 %	50 %	384044058
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2743	NC_017136	CGTC	2	8	183587	183594	0 %	25 %	25 %	50 %	384044064
2744	NC_017136	TGTCC	2	10	183599	183608	0 %	40 %	20 %	40 %	384044064
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.